MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020834	CAAA	2	8	253589	253596	75 %	0 %	0 %	25 %	472335508
5002	NC_020834	A	6	6	253594	253599	100 %	0 %	0 %	0 %	472335508
5003	NC_020834	A	6	6	253611	253616	100 %	0 %	0 %	0 %	472335508
5004	NC_020834	A	7	7	253694	253700	100 %	0 %	0 %	0 %	472335508
5005	NC_020834	CA	3	6	253762	253767	50 %	0 %	0 %	50 %	472335508
5006	NC_020834	CCA	2	6	253768	253773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335508
5007	NC_020834	TTTA	2	8	253883	253890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020834	A	7	7	253947	253953	100 %	0 %	0 %	0 %	472335509
5009	NC_020834	A	8	8	253956	253963	100 %	0 %	0 %	0 %	472335509
5010	NC_020834	AAAG	2	8	253968	253975	75 %	0 %	25 %	0 %	472335509
5011	NC_020834	TTC	2	6	254019	254024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335509
5012	NC_020834	ATA	2	6	254182	254187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335509
5013	NC_020834	CGG	2	6	254221	254226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335509
5014	NC_020834	AGC	2	6	254233	254238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335509
5015	NC_020834	GAA	2	6	254244	254249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335509
5016	NC_020834	AAG	3	9	254260	254268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335509
5017	NC_020834	CAA	2	6	254292	254297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335509
5018	NC_020834	GAA	3	9	254364	254372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335509
5019	NC_020834	AGC	2	6	254375	254380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335509
5020	NC_020834	A	7	7	254381	254387	100 %	0 %	0 %	0 %	472335509
5021	NC_020834	AAGC	2	8	254412	254419	50 %	0 %	25 %	25 %	472335509
5022	NC_020834	A	6	6	254448	254453	100 %	0 %	0 %	0 %	472335509
5023	NC_020834	CAG	2	6	254454	254459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335509
5024	NC_020834	A	6	6	254466	254471	100 %	0 %	0 %	0 %	472335509
5025	NC_020834	AGC	2	6	254473	254478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335509
5026	NC_020834	TGC	2	6	254498	254503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335509
5027	NC_020834	GCAA	2	8	254591	254598	50 %	0 %	25 %	25 %	472335509
5028	NC_020834	TG	3	6	254727	254732	0 %	50 %	50 %	0 %	472335509
5029	NC_020834	ATTG	2	8	254749	254756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020834	AG	3	6	254766	254771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020834	CT	3	6	254779	254784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_020834	T	7	7	254784	254790	0 %	100 %	0 %	0 %	472335510
5033	NC_020834	GCTT	2	8	254814	254821	0 %	50 %	25 %	25 %	472335510
5034	NC_020834	TAA	2	6	254882	254887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335510
5035	NC_020834	T	6	6	255002	255007	0 %	100 %	0 %	0 %	472335510
5036	NC_020834	CAAG	2	8	255028	255035	50 %	0 %	25 %	25 %	472335510
5037	NC_020834	ACC	2	6	255114	255119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335510
5038	NC_020834	CTG	2	6	255250	255255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335510
5039	NC_020834	T	6	6	255277	255282	0 %	100 %	0 %	0 %	472335510
5040	NC_020834	GTG	2	6	255283	255288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335510
5041	NC_020834	AAC	2	6	255299	255304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335510
5042	NC_020834	TTG	2	6	255359	255364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335510
5043	NC_020834	GGT	2	6	255392	255397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335510
5044	NC_020834	GCCC	2	8	255449	255456	0 %	0 %	25 %	75 %	472335510
5045	NC_020834	CAG	2	6	255494	255499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335510
5046	NC_020834	GCA	2	6	255504	255509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335510
5047	NC_020834	GTT	2	6	255638	255643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335510
5048	NC_020834	A	6	6	255688	255693	100 %	0 %	0 %	0 %	472335510
5049	NC_020834	CAA	2	6	255754	255759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335510
5050	NC_020834	CAA	2	6	255872	255877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335510
5051	NC_020834	TGC	2	6	255917	255922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335510
5052	NC_020834	T	6	6	255970	255975	0 %	100 %	0 %	0 %	472335510
5053	NC_020834	TTAG	2	8	255984	255991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020834	CAA	2	6	256190	256195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335511
5055	NC_020834	TGAA	2	8	256231	256238	50 %	25 %	25 %	0 %	472335511
5056	NC_020834	GCC	2	6	256260	256265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335511
5057	NC_020834	TGC	2	6	256269	256274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335511
5058	NC_020834	CAC	2	6	256359	256364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335511
5059	NC_020834	ATT	3	9	256444	256452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_020834	TGA	2	6	256545	256550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335512
5061	NC_020834	TATC	2	8	256720	256727	25 %	50 %	0 %	25 %	472335512
5062	NC_020834	AAG	2	6	256773	256778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335512
5063	NC_020834	CGATTG	2	12	256797	256808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	472335512
5064	NC_020834	TTA	2	6	256844	256849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335512
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5066	NC_020834	GCACG	2	10	256903	256912	20 %	0 %	40 %	40 %	472335512
5067	NC_020834	GAT	2	6	256951	256956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335512
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5069	NC_020834	GTT	2	6	257023	257028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335512
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5071	NC_020834	CAA	2	6	257047	257052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335512
5072	NC_020834	CAA	2	6	257144	257149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335512
5073	NC_020834	ACC	2	6	257209	257214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335512
5074	NC_020834	GAG	2	6	257276	257281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335512
5075	NC_020834	AAC	2	6	257343	257348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335512
5076	NC_020834	TTCG	2	8	257355	257362	0 %	50 %	25 %	25 %	472335512
5077	NC_020834	TGG	2	6	257382	257387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335512
5078	NC_020834	AAAT	2	8	257417	257424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_020834	AAAT	2	8	257437	257444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_020834	ATC	2	6	257479	257484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_020834	TTA	3	9	257618	257626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335513
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5083	NC_020834	ATT	2	6	257803	257808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335513
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5085	NC_020834	TGA	2	6	258014	258019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335513
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5088	NC_020834	ATG	2	6	258087	258092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335513
5089	NC_020834	A	7	7	258230	258236	100 %	0 %	0 %	0 %	472335513
5090	NC_020834	A	6	6	258293	258298	100 %	0 %	0 %	0 %	472335513
5091	NC_020834	AATAGA	2	12	258344	258355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472335513
5092	NC_020834	TTGAA	2	10	258376	258385	40 %	40 %	20 %	0 %	472335513
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5094	NC_020834	TAA	2	6	258503	258508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335513
5095	NC_020834	ACA	2	6	258628	258633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335513
5096	NC_020834	AG	3	6	258695	258700	50 %	0 %	50 %	0 %	472335513
5097	NC_020834	TGA	2	6	258803	258808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335513
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5099	NC_020834	GGAAT	2	10	258869	258878	40 %	20 %	40 %	0 %	472335513
5100	NC_020834	CAA	2	6	258956	258961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335513
5101	NC_020834	TGAT	2	8	259027	259034	25 %	50 %	25 %	0 %	472335513
5102	NC_020834	ATT	2	6	259142	259147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335513
5103	NC_020834	TCA	3	9	259157	259165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335513
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5105	NC_020834	AGT	2	6	259248	259253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335513
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5107	NC_020834	AAC	2	6	259338	259343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335514
5108	NC_020834	T	6	6	259376	259381	0 %	100 %	0 %	0 %	472335514
5109	NC_020834	CAA	2	6	259406	259411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335514
5110	NC_020834	AAT	2	6	259439	259444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335514
5111	NC_020834	TCTT	2	8	259496	259503	0 %	75 %	0 %	25 %	472335514
5112	NC_020834	ATT	2	6	259513	259518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335514
5113	NC_020834	T	6	6	259517	259522	0 %	100 %	0 %	0 %	472335514
5114	NC_020834	GTT	2	6	259541	259546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335514
5115	NC_020834	A	6	6	259562	259567	100 %	0 %	0 %	0 %	472335514
5116	NC_020834	AGT	2	6	259600	259605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335514
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5118	NC_020834	AT	3	6	259795	259800	50 %	50 %	0 %	0 %	472335514
5119	NC_020834	ATC	2	6	259872	259877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335514
5120	NC_020834	CAA	2	6	259922	259927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335514
5121	NC_020834	GTCA	2	8	259933	259940	25 %	25 %	25 %	25 %	472335514
5122	NC_020834	AAC	2	6	259946	259951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335514
5123	NC_020834	TGC	2	6	259969	259974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335514
5124	NC_020834	GCA	2	6	260081	260086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335514
5125	NC_020834	GAA	2	6	260181	260186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335514
5126	NC_020834	TTA	2	6	260187	260192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335514
5127	NC_020834	TAGA	2	8	260247	260254	50 %	25 %	25 %	0 %	472335514
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5131	NC_020834	GATA	2	8	260372	260379	50 %	25 %	25 %	0 %	472335514
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5233	NC_020834	TA	3	6	264779	264784	50 %	50 %	0 %	0 %	472335515
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5241	NC_020834	GAT	2	6	265055	265060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335515
5242	NC_020834	TA	3	6	265122	265127	50 %	50 %	0 %	0 %	472335515
5243	NC_020834	TG	3	6	265144	265149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_020834	CA	3	6	265160	265165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5245	NC_020834	TCT	2	6	265180	265185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
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5247	NC_020834	TCT	2	6	265235	265240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
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5249	NC_020834	CTT	2	6	265314	265319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
5250	NC_020834	TTC	2	6	265327	265332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
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5253	NC_020834	CCA	2	6	265409	265414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335516
5254	NC_020834	CA	3	6	265469	265474	50 %	0 %	0 %	50 %	472335516
5255	NC_020834	ATTT	2	8	265491	265498	25 %	75 %	0 %	0 %	472335516
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5262	NC_020834	AGTT	2	8	265737	265744	25 %	50 %	25 %	0 %	472335516
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5292	NC_020834	TA	3	6	266859	266864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_020834	TAA	2	6	266877	266882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5294	NC_020834	CTAT	2	8	266892	266899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5295	NC_020834	AGT	2	6	266924	266929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5297	NC_020834	ATT	2	6	266983	266988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5318	NC_020834	TGA	2	6	267789	267794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5358	NC_020834	TCTTG	2	10	270789	270798	0 %	60 %	20 %	20 %	472335521
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5370	NC_020834	CCG	2	6	271225	271230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335522
5371	NC_020834	AAAAT	2	10	271237	271246	80 %	20 %	0 %	0 %	472335522
5372	NC_020834	TGA	2	6	271249	271254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
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5499	NC_020834	CTG	2	6	277803	277808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335528
5500	NC_020834	TA	3	6	277809	277814	50 %	50 %	0 %	0 %	472335528

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